프리랜서 3.3% 원천징수, “세금 끝!”이 아닌 이유: 5월 정산 구조를 가장 쉽게 풀어드립니다

프리랜서 3.3% 원천징수의 의미와 종합소득세 신고로 최종 정산되는 구조를 예시·도표로 쉽게 정리합니다.

 

 

프리랜서 3.3% 원천징수, “세금 끝!”이 아닌 이유: 5월 정산 구조를 가장 쉽게 풀어드립니다

 

 

 

 

목차

서론: 3.3% 떼였는데… 왜 5월에 또 세금 얘기가 나올까?

프리랜서로 일하다 보면 계약서나 정산서에 꼭 따라붙는 문장이 있죠. “프리랜서 3.3% 원천징수 후 지급”.
월급처럼 매달 떼가니 “아, 세금은 이미 낸 거네” 싶지만, 5월이 되면 종합소득세 신고 안내가 오고, 어떤 사람은 추가 납부, 어떤 사람은 환급을 받습니다.

핵심은 딱 한 줄이에요.

**프리랜서 3.3% 원천징수는 ‘최종 세금’이 아니라 ‘미리 낸 세금(선납)’**입니다.

오늘 글에서는 프리랜서 3.3% 원천징수가 정확히 무엇인지, 정산(최종 세금) 구조가 왜 그렇게 돌아가는지, 그리고 5월에 “내가 더 내야 하는지/돌려받는지”를 도표와 숫자 예시로 쉽게 정리해볼게요.

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본론 1) 프리랜서 3.3% 원천징수 = 소득세 3% + 지방소득세 0.3%

먼저 3.3%의 정체부터요. 흔히 말하는 프리랜서 3.3% 원천징수는 보통 아래처럼 구성됩니다.

• 소득세 3%
• 지방소득세 0.3%(= 원천징수된 소득세의 10%)

즉, 100만 원을 벌면 대략 33,000원이 먼저 빠지고(원천징수), 나머지를 받는 구조죠. 

왜 “미리” 떼는 걸까?

프리랜서(인적용역 등) 소득은 급여처럼 회사가 연말정산으로 딱 맞추기 어렵습니다. 그래서 지급할 때 일정 비율을 미리 징수해두고, 다음 해 5월에 종합소득세 신고로 정확히 계산해 “더 내거나/돌려받는” 방식이에요. 

참고로 국세청은 원천징수 전반(지급명세서 제출, 가산세 등) 구조를 안내하고 있어요. 

(중요) 소액이라도 원천징수되는 경우가 있어요

국세청 안내에 따르면 **인적용역 사업소득(’24.7.1 이후 지급분)**은 원천징수 세액이 1,000원 미만이어도 원천징수해야 한다는 점이 강조됩니다. “소액이니까 안 떼도 되겠지”가 통하지 않는 케이스가 생긴 거예요. 

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본론 2) “정산”의 진짜 무대는 5월: 종합소득세 신고가 최종 결승전

프리랜서의 세금은 보통 **다음 해 5월(5/1~5/31)**에 종합소득세 신고로 최종 확정됩니다. (예: 2026년 5월 신고 = 2025년 소득분) 

정산 구조 한 장 요약(흐름도)

아래처럼 생각하면 가장 이해가 빨라요.

 

[일감 수행]

↓

[대금 지급] — (프리랜서 3.3% 원천징수) → [국세/지방세로 선납]

↓

[내년 5월 종합소득세 신고]

↓

(연간 총수입 - 필요경비 - 공제 = 과세표준)

↓

[산출세액 계산(누진세율)]

↓

[기납부세액(원천징수 3.3%) 차감]

↓

추가 납부 or 환급

↓

[지방소득세도 함께 정산/신고]

• 종합소득세는 구간별 누진세율(6%~45%) 구조예요. 
• 지방소득세는 보통 **소득세의 10%**가 따라붙는 구조(특별징수/신고)로 안내됩니다. 

“연말정산”이 아니라 “종합소득세 신고”인 이유

직장인(근로소득)은 회사가 연말정산을 해주지만, 프리랜서(주로 사업소득)는 원칙적으로 본인이 종합소득세 신고로 소득·경비·공제를 반영해 최종세액을 확정합니다.

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본론 3) 사업소득? 기타소득? 3.3% vs 8.8%가 헷갈리는 이유

프리랜서 정산에서 가장 흔한 혼동이 이거예요.

• 어떤 곳은 3.3% 원천징수
• 어떤 곳은 8.8% 원천징수(혹은 더 큰 비율)

핵심 구분: “계속/반복”이면 사업소득, “일시/우발”이면 기타소득인 경우가 많다

정부 안내에서는 원천징수의 큰 틀을 이렇게 설명합니다.

• 사업소득: 독립된 자격으로 계속적으로 용역 제공 → 수입금액의 3% 원천징수(지방세 별도) 
• 기타소득: 일시적으로 용역 제공 → 기타소득 관련 원천징수(기본 20% 등) 

그리고 지방소득세는 원천징수된 소득세액의 10%로 붙는 구조가 안내되어, 최종 체감세율이 달라집니다. 

그럼 “8.8%”는 왜 나오나?

현장에서 “강연료/자문료/원고료” 같은 항목이 기타소득으로 처리될 때, 필요경비를 일정 비율로 인정해 과세표준이 줄어든 상태에서 원천징수되면서, 결과적으로 “총액 대비 약 8.8%”처럼 보이는 케이스가 생깁니다(처리 방식/항목에 따라 다름).
즉, 프리랜서 3.3% 원천징수는 주로 사업소득 쪽에서 많이 보이고, 기타소득은 구조가 달라 “세율이 더 커 보이는” 일이 생겨요.

현실 팁: “나는 프리랜서인데 무조건 3.3%”라고 단정하면 위험해요. 계약 형태, 지급 항목, 반복성에 따라 사업소득/기타소득 분류가 달라질 수 있습니다.

한눈에 보는 비교표

 

구분	대표 상황	원천징수에서 자주 보이는 숫자	최종 정산
근로소득	고용관계/급여	간이세액표(급여구간별)	회사 연말정산
사업소득(인적용역)	프리랜서 프로젝트·외주가 반복	프리랜서 3.3% 원천징수(3%+0.3%)	본인 종합소득세 신고(5월)
기타소득	일시적 강연·일회성 사례 등	항목별 원천징수(기본 20% 등)	종합소득 합산/분리과세 등 케이스별

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본론 4) 숫자로 끝내는 “추가납부 vs 환급” 시뮬레이션

이제 가장 궁금한 부분.
프리랜서 3.3% 원천징수를 했는데, 왜 누구는 더 내고 누구는 환급받을까요?

정답은 **“연간으로 다시 계산하니까”**예요. 종합소득세는 누진세율이라, 1년 전체 소득·경비·공제를 합쳐야 최종이 나옵니다. 

예시 A: “생각보다 세금이 더 나오는” 케이스(추가 납부)

• 연 매출(수입): 50,000,000원
• 프리랜서 3.3% 원천징수로 미리 낸 세금: 1,650,000원
• 필요경비 반영 후 과세표준(단순화 가정): 30,000,000원

종합소득세율표(예: 1,400만~5,000만 구간 15%, 누진공제 1,260,000원) 기준으로 단순 계산하면:

• 산출세액 ≈ 30,000,000 × 15% − 1,260,000 = 3,240,000원
• (지방소득세 10% 가정) ≈ 324,000원
• 합계 ≈ 3,564,000원
• 기납부(원천징수) 1,650,000원을 빼면 → 추가 납부 약 1,914,000원

※ 실제는 소득공제/세액공제/장부 유형 등에 따라 달라요. 다만 “3.3%는 고정”인데 “최종세율은 누진”이라 추가 납부가 생길 수 있다는 감각을 잡는 예시입니다. 

예시 B: “환급이 나는” 케이스(돌려받기)

• 연 수입은 크지 않은데(또는)
• 경비/공제가 충분히 반영돼 과세표준이 낮아지면
  최종 산출세액이 **기납부(프리랜서 3.3% 원천징수)**보다 작아져서 환급이 나올 수 있어요. 

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도표로 정리: 내 상황은 어디에 가까울까?

1) 결과 3가지(간단 차트)

 

상황	특징	결론
소득이 크고 경비/공제가 적다	누진세율로 최종세액↑	추가 납부 가능성↑
소득이 중간, 경비/공제가 보통	3.3%와 최종세액 비슷	비슷하거나 소폭
소득이 낮거나 경비/공제가 크다	최종세액↓	환급 가능성↑

2) 5월 신고 준비 체크리스트

• 1년간 받은 건별 정산 내역(거래처별)
• 지급명세서/원천징수영수증 확인(홈택스) 
• 경비 자료(계좌이체, 카드내역, 영수증 등)
• 국민연금/건강보험료 등 공제 관련 자료(해당 시)
• “사업소득 vs 기타소득” 분류가 애매한 건 계약서/지급명세서로 재확인

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실무에서 진짜 자주 나오는 질문 3가지

Q1) 거래처가 3.3%를 안 떼고 줬어요. 그럼 세금 안 내도 되나요?

아니요. 프리랜서 소득은 종합소득세 신고에서 합산됩니다. 원천징수를 했든 안 했든, 소득이 발생했다면 신고 대상이 될 수 있어요. 그리고 원천징수·지급명세서 제출 의무는 지급자 측 이슈(가산세 등)로도 연결될 수 있습니다.

Q2) “프리랜서 3.3% 원천징수”면 무조건 사업소득인가요?

대부분 그렇게 처리되지만, 계약 형태/반복성/지급 항목에 따라 달라질 수 있어요. 헷갈리면 지급명세서 유형과 계약서를 함께 확인하는 게 안전합니다. (사업소득/기타소득 구분은 실무에서 정말 중요)

Q3) 원천징수영수증은 어디서 봐요?

국세청 안내에 따르면 원천징수의무자는 영수증 발급 의무가 있고, 실무적으로는 홈택스에서 지급명세서·원천징수영수증 내역을 확인하는 흐름이 많이 쓰입니다. 

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결론: 3.3%는 “끝”이 아니라 “시작”이다

정리하면 이렇습니다.

• 프리랜서 3.3% 원천징수는 최종세금이 아니라 선납(미리 낸 세금)
• 최종 결론은 매년 5월 종합소득세 신고에서 확정
• 소득(연간)·경비·공제에 따라 추가 납부/환급이 갈림
• “사업소득 vs 기타소득” 분류에 따라 원천징수 체감이 달라질 수 있음 

다음 단계로는 이런 질문을 던져보면 좋아요.

• “나는 경비를 제대로 모으고 있나?”
• “내 소득은 사업소득으로 반복성이 있는가, 기타소득으로 일시성이 강한가?”
• “5월에 놀라지 않도록, 월별로 **세금 적립(예: 8~15%)**을 해둘 필요는 없나?”

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FAQ (검색량 높은 질문 6가지)

1) 프리랜서 3.3% 원천징수는 무조건 내야 하나요?

대체로 인적용역 사업소득 지급 시 원천징수로 처리되는 경우가 많습니다. 다만 계약 형태/소득 분류에 따라 달라질 수 있어요. 

2) 3.3% 떼면 종합소득세 신고 안 해도 되나요?

아니요. 사업소득은 금액과 관계없이 종합소득세 신고 의무가 있다는 안내가 널리 안내됩니다. 

3) 종합소득세 신고는 언제 하나요?

통상 다음 해 5월(5/1~5/31)에 신고·납부합니다. 지방소득세도 함께 신고 흐름이 연결됩니다. 

4) 프리랜서 3.3% 원천징수 환급은 어떤 사람이 많이 받나요?

연간 소득이 낮거나, 필요경비/공제 반영으로 과세표준이 낮아져 최종세액이 기납부세액(3.3%)보다 작아지는 경우 환급이 발생할 수 있어요.

5) 원천징수영수증(지급명세서)은 꼭 챙겨야 하나요?

네. 국세청은 원천징수의무자의 영수증 발급 안내를 제공하고 있고, 신고 시 본인 확인에도 도움이 됩니다.

6) 3.3%가 아니라 8.8%를 떼던데요?

기타소득 등 다른 소득 분류/경비 인정 방식이 반영돼 체감 원천징수율이 달라질 수 있어요. 기타소득 원천징수(기본 20% 등) 구조는 정부/국세청 안내에서 확인할 수 있습니다. 

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내부 링크

 

‘프리랜서 3.3% 돌려받기’ 끝장 가이드: 필요경비 인정 포인트와 영수증 정리법으로 환급까지

 

프리랜서/크리에이터 종합소득세 가이드: 3.3%로 끝나지 않는 이유와 경비처리·환급 실전 노하우

 

관련 외부 레퍼런스

• 정부 정책브리핑(korea.kr): 원천징수 상식/구분 

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